MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2540

Total Repeats: 67922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018586	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018586	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018586	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018586	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018586	G	6	6	307	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018586	CAAT	2	8	322	329	50 %	25 %	0 %	25 %	405754080
7	NC_018586	A	8	8	364	371	100 %	0 %	0 %	0 %	405754080
8	NC_018586	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405754080
9	NC_018586	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754080
10	NC_018586	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405754080
11	NC_018586	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754080
12	NC_018586	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754080
13	NC_018586	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405754080
14	NC_018586	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405754080
15	NC_018586	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405754080
16	NC_018586	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754080
17	NC_018586	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405754080
18	NC_018586	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754080
19	NC_018586	CTTA	2	8	945	952	25 %	50 %	0 %	25 %	405754080
20	NC_018586	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754080
21	NC_018586	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754080
22	NC_018586	AC	3	6	1016	1021	50 %	0 %	0 %	50 %	405754080
23	NC_018586	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754080
24	NC_018586	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754080
25	NC_018586	GACC	2	8	1057	1064	25 %	0 %	25 %	50 %	405754080
26	NC_018586	GAAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	25 %	0 %	405754080
27	NC_018586	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	405754080
28	NC_018586	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	405754080
29	NC_018586	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754080
30	NC_018586	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405754080
31	NC_018586	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405754080
32	NC_018586	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405754080
33	NC_018586	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754080
34	NC_018586	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754080
35	NC_018586	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754080
36	NC_018586	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	405754080
37	NC_018586	AG	3	6	1498	1503	50 %	0 %	50 %	0 %	405754080
38	NC_018586	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754080
39	NC_018586	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405754080
40	NC_018586	A	6	6	1580	1585	100 %	0 %	0 %	0 %	405754080
41	NC_018586	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405754080
42	NC_018586	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	405754080
43	NC_018586	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018586	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018586	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018586	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018586	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405754081
48	NC_018586	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754081
49	NC_018586	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754081
50	NC_018586	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405754081
51	NC_018586	TCAA	2	8	2098	2105	50 %	25 %	0 %	25 %	405754081
52	NC_018586	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405754081
53	NC_018586	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754081
54	NC_018586	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	405754081
55	NC_018586	TACT	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	405754081
56	NC_018586	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754081
57	NC_018586	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405754081
58	NC_018586	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	405754081
59	NC_018586	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754081
60	NC_018586	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405754081
61	NC_018586	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	405754081
62	NC_018586	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754081
63	NC_018586	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405754081
64	NC_018586	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754081
65	NC_018586	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405754081
66	NC_018586	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754081
67	NC_018586	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754081
68	NC_018586	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018586	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754082
70	NC_018586	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405754082
71	NC_018586	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	405754082
72	NC_018586	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754082
73	NC_018586	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405754082
74	NC_018586	GCTG	2	8	3261	3268	0 %	25 %	50 %	25 %	405754082
75	NC_018586	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	405754082
76	NC_018586	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754082
77	NC_018586	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754082
78	NC_018586	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405754082
79	NC_018586	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	405754082
80	NC_018586	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754082
81	NC_018586	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754082
82	NC_018586	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405754082
83	NC_018586	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	405754082
84	NC_018586	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	405754082
85	NC_018586	TA	3	6	3671	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	405754082
86	NC_018586	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405754082
87	NC_018586	TTCT	2	8	3713	3720	0 %	75 %	0 %	25 %	405754082
88	NC_018586	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405754082
89	NC_018586	GC	3	6	3786	3791	0 %	0 %	50 %	50 %	405754082
90	NC_018586	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405754082
91	NC_018586	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405754082
92	NC_018586	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	405754082
93	NC_018586	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405754082
94	NC_018586	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405754082
95	NC_018586	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754082
96	NC_018586	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754082
97	NC_018586	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405754082
98	NC_018586	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754082
99	NC_018586	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	405754082
100	NC_018586	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405754082
101	NC_018586	AGTT	2	8	4301	4308	25 %	50 %	25 %	0 %	405754082
102	NC_018586	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405754082
103	NC_018586	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	405754082
104	NC_018586	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754082
105	NC_018586	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018586	T	8	8	4504	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018586	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018586	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_018586	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018586	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018586	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018586	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018586	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	405754083
114	NC_018586	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405754083
115	NC_018586	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	405754084
116	NC_018586	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405754084
117	NC_018586	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754084
118	NC_018586	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754084
119	NC_018586	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754084
120	NC_018586	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	405754084
121	NC_018586	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405754084
122	NC_018586	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	405754084
123	NC_018586	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	405754084
124	NC_018586	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405754084
125	NC_018586	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	405754084
126	NC_018586	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	405754084
127	NC_018586	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405754084
128	NC_018586	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754084
129	NC_018586	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754084
130	NC_018586	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405754084
131	NC_018586	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754084
132	NC_018586	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754084
133	NC_018586	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405754084
134	NC_018586	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405754084
135	NC_018586	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	405754084
136	NC_018586	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018586	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018586	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_018586	A	6	6	18670	18675	100 %	0 %	0 %	0 %	405754093
402	NC_018586	TTC	2	6	18687	18692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405754093
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404	NC_018586	GTTT	2	8	18717	18724	0 %	75 %	25 %	0 %	405754093
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433	NC_018586	TTCA	2	8	20091	20098	25 %	50 %	0 %	25 %	405754095
434	NC_018586	CGC	2	6	20177	20182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	405754095
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436	NC_018586	T	8	8	20302	20309	0 %	100 %	0 %	0 %	405754096
437	NC_018586	AT	3	6	20319	20324	50 %	50 %	0 %	0 %	405754096
438	NC_018586	TAATT	2	10	20369	20378	40 %	60 %	0 %	0 %	405754096
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452	NC_018586	T	6	6	21088	21093	0 %	100 %	0 %	0 %	405754096
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454	NC_018586	ATT	2	6	21163	21168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405754096
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458	NC_018586	ACG	2	6	21299	21304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405754096
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460	NC_018586	ATG	2	6	21344	21349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754096
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463	NC_018586	TAA	2	6	21381	21386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405754096
464	NC_018586	T	7	7	21409	21415	0 %	100 %	0 %	0 %	405754096
465	NC_018586	T	6	6	21426	21431	0 %	100 %	0 %	0 %	405754096
466	NC_018586	CTC	2	6	21432	21437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
467	NC_018586	T	8	8	21500	21507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_018586	A	6	6	21562	21567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_018586	ATT	2	6	21574	21579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_018586	GA	3	6	21632	21637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_018586	TTG	2	6	21752	21757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405754097
473	NC_018586	GGAC	2	8	21777	21784	25 %	0 %	50 %	25 %	405754097
474	NC_018586	ATC	2	6	21866	21871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405754097
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497	NC_018586	AAGC	2	8	22679	22686	50 %	0 %	25 %	25 %	405754097
498	NC_018586	AGA	2	6	22806	22811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405754097
499	NC_018586	TGA	2	6	22824	22829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405754097
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